全面了解界定肺功能的細胞和微環(huán)境對于減少肺部疾病的影響非常重要，目前肺部疾病在全球死亡原因中占比明顯。肺除了主要的氣體交換功能外，還有重要的屏障功能。雖然其他粘膜屏障組織通過明確的粘膜相關淋巴組織(MALT)調(diào)節(jié)適應性免疫，但在健康人類肺部尚未報道這種次級淋巴結(jié)構(gòu)。LungMAP和人類肺細胞圖譜(HLCA)聯(lián)盟利用了單細胞和單核RNA測序(scRNA-seq和snRNA-seq)的最新進展，并生成了許多描述跨物種、健康和疾病的肺細胞類型的圖譜。

目前的圖譜優(yōu)先考慮實質(zhì)組織，很少有研究檢查氣道的全深度。研究人員從死亡器官捐贈者的健康肺和氣道中進行了深層組織分析，允許沿著呼吸樹的近端到遠端軸描述細胞類型。

相關研究發(fā)表在《Nature Genetics》上，文章標題為：“A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche"。

研究人員使用無偏空間轉(zhuǎn)錄組學(ST)方法，在健康人類肺和氣道的組織微環(huán)境中對細胞類型和狀態(tài)進行背景分析，為HLCA添加了一個關鍵維度。

總的來說，共測序了129,340個單細胞和63,768個單核，并對來自人類氣管、支氣管和上下薄壁的20個組織切片進行了Visium ST。這些數(shù)據(jù)和CellTypist自動注釋模型可在lungcellatlas.org上獲得，作為數(shù)據(jù)下載、懸浮和空間基因表達分析的資源，以及新數(shù)據(jù)集的自動注釋。

研究人員區(qū)分了80種細胞類型和狀態(tài)，其中包括11種在以前的肺圖譜研究中未注釋的細胞群。這些人群中許多表達功能性全基因組關聯(lián)研究(fGWAS)分析突出的疾病相關基因。我們深入的組織分析與空間基因組學結(jié)合，在全分子寬度上重建了肺和氣道中的已知組織微環(huán)境。超越已知的細胞組織單位，我們在氣道粘膜下腺(SMG)確定了IgA漿細胞先前未定義的免疫生態(tài)位。

分子相關實驗室，需要經(jīng)常對環(huán)境中的DNA、RNA及DNA酶、RNA酶進行高效清除及控制，推薦使用MB公司的PCR Clean，即用型產(chǎn)品，保障分子實驗結(jié)果的穩(wěn)定。